VAU suunnittelee, järjestää, kehittää ja koordinoi 37 lajin harraste- ja kilpailutoimintaa. Sekä joukkue- että yksilölajeissa kaikilla on mahdollisuus harrastaa tai kilpailla omalla tasollaan. Harraste- ja kilpailutoimintaa järjestetään liikunta-, näkö- ja kehitysvammaisille sekä elinsiirron saaneille harrastajille ja urheilijoille.

Liikunnan harrastaminen sen monissa eri muodoissaan on yksi suomalaisten suosituimmista vapaa-ajanviettotavoista. VAU tarjoaa jokaiselle mahdollisuuden löytää oma harrasteryhmä tai kilpailulaji. Harrastaja voi toimia myös avustajana, ohjaajana, valmentajana, oman yhdistyksen vammaisten liikuntapalvelujen edunvalvojana tai penkkiurheilijana.

Kilpailutoimintaan osallistuvilla tulee olla kansallinen tai kansainvälinen luokittelu, jonka tekevät laji- tai vammakohtaiset koulutetut luokittelijat. VAU:n valitsemat urheilijat osallistuvat joka neljäs vuosi elinsiirron saaneiden Maailmankisoihin, kehitysvammaisten Special Olympics -kilpailuihin ja Inas Fid EM- ja MM-kilpailuihin, näkövammaisten IBSA World Games kilpailuihin sekä muihin VAU:n vastuulla olevien lajien kansainvälisiin arvokilpailuihin. Suomen Paralympiakomitea valitsee ja lähettää urheilijat paralympialaisiin. Integraatiolajeissa lajiliitto vastaa urheilijoiden lähettämisestä arvokilpailuihin.

Lajitoiminnoista VAU:ssa vastaavat kilpa- ja huippu-urheilun toimialapäällikkö yhdessä lajikoordinaattoreiden sekä eri vammaryhmien edustajista koostuvien lajijaostojen kanssa. Jaostot tekevät lajien toiminta- ja kehittämissuunnitelmat.